如果开具的是增值税专用发票，必须将款打入企业的公户，否则不能抵扣进项税额。如果是企业之间购销业务开具增值税普通发票，最好通过公户转账。
开具增值税发票和私人打款还是公司打款没关系，主要是看受票单位不能是个人，必须是一般纳税人。
只要对方有合法的一般纳税人身份，能够提供完整的开票信息，回款方式不再是你们关注的重点。
或许对方是公司委托支付，或者对方是和公司有债务纠纷代付等等情况。
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法律依据

《中华人民共和国增值税暂行条例》第二条,增值税税率：

(一)纳税人销售货物、劳务、有形动产租赁服务或者进口货物，除本条第二项、第四项、第五项另有规定外，税率为17%。

(二)纳税人销售交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权，销售或者进口下列货物，税率为11%：

1.粮食等农产品、食用植物油、食用盐;

2.自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、二甲醚、沼气、居民用煤炭制品;

3.图书、报纸、杂志、音像制品、电子出版物;

4.饲料、化肥、农药、农机、农膜;

5.国务院规定的其他货物。

(三)纳税人销售服务、无形资产，除本条第一项、第二项、第五项另有规定外，税率为6%。

(四)纳税人出口货物，税率为零;但是，国务院另有规定的除外。

(五)境内单位和个人跨境销售国务院规定范围内的服务、无形资产，税率为零。

税率的调整，由国务院决定。