公司股东变更国籍，对公司性质没有影响。我国认定公司性质是内资企业或中外合资企业的标准并非仅根据公司股东国籍进行判断，对股东出资来源是境内或境外是重要判断依据。根据我国相关法律法规的规定，境内公司的股东变更国籍，不会改变公司原有的性质，该部分投资不属于外资，企业性质不属于中外合资企业，变更国籍的股东所持的股份为内资股。
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【延伸知识】现行法律法规中并无对于股东变更国籍后是否需要进行工商变更登记的强制性规定，在名称、地址、负责人、经营范围、经营方式、经济性质、隶属关系、资金数额的公司主要注册事项不发生变化的情况下，一般不需要办理工商登记变更。

法律依据

《关于外国投资者并购境内企业的规定》第五十五条，境内公司的自然人股东变更国籍的，不改变该公司的企业性质。